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在规模化繁殖技术方面，南山睡莲种苗基地采用高效的繁殖方式，实现种苗的批量生产。其中，组培快繁技术是主要的繁殖手段之一，通过在无菌环境下培养睡莲的茎尖、南山叶片等组织，诱导分化出完整的植株，这种方式繁殖速度快，1 个外植体在短期内可繁殖出数百株组培苗，且能有效避免病虫害传播，确保种苗品质均匀；分株繁殖则作为辅助繁殖方式，用于繁殖一些不适宜组培的品种，通过分割母株的块茎，获得带有芽点的种苗，分株繁殖的种苗生长速度快，定植后成活率高。为提高繁殖效率，基地还建立了自动化的育苗系统，实现播种、南山当地浇水、南山当地施肥、南山当地环境调控的自动化操作，减少人工成本，提高生产效率。
南山睡莲种苗是用于规模化繁殖与种植的核心繁殖材料，相较于普通睡莲苗，其遗传稳定性更强、南山附近品种纯度更高，能有效保障后续种植的统一性与产量，广泛应用于睡莲种植基地、南山当地生态工程及园林景观项目。从种苗分类来看，南山睡莲种苗主要分为分株种苗与播种种苗两类：分株种苗是通过母株分株繁殖获得，具有生长速度快、南山附近开花时间早的优势，一般定植后 1-2 个月即可开花，适合短期见效的种植项目；播种种苗是通过种子培育而成，成本较低，但生长周期较长，从播种到开花需 6-8 个月，且品种纯度易受环境影响，适合长期规模化育苗基地。
种植实施过程需注重细节把控，确保植株成活率与生长质量。首先是种植时间选择，种植时间为春季 3-4 月，此时气温回升至 15℃以上，水温稳定在 20℃左右，睡莲根系活力强，定植后易成活；若在夏季种植，需避免高温时段，选择傍晚或阴天进行，定植后适当遮阴，防止叶片失水枯萎；秋季种植需在 10 月前完成，确保植株在冬季来临前形成足够的根系，提高抗寒能力。其次是种植方法，根据水域深度分为浅水区种植与深水区种植：浅水区（水深 0.5m 以下）可直接将种茎埋入塘泥中，种植深度为 10-15cm，种茎芽点朝上，间距 30-40cm；深水区（水深 0.5-1.5m）需使用种植篮，种植篮内填充塘泥与河沙（比例 3:1），将种茎放入种植篮后，在表面覆盖一层鹅卵石，防止土壤流失，再将种植篮固定在水域底部，确保芽点露出土壤表面。
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